Program Studi Manajemen merupakan program studi tertua di Unika Atma Jaya yang didirikan sejak tahun 1960.  Lulusan prodi manajemen akan memperoleh  pengetahuan manajemen dan bisnis yang mengedepankan IPTEKS, tata kelola organisasi yang baik dan berkelanjutan, agar dapat berkarir sebagai manajer, peneliti dan dan wirausahawan yang profesional, beretika, berorientasi global serta tanggap terhadap perubahan dan kepentingan masyarakat. 

Prodi Manajemen memiliki 4 peminatan, yaitu manajemen pemasaran, sumber daya manusia, keuangan dan bisnis.  Prodi Manajemen dilengkapi dengan kurikulum yang dapat diselesaikan dalam waktu 6 – 7 semester.